科學報導 諾貝爾獎 Nobel Prize

老化的微觀視角:miR-29 揭示老化新篇章

MicroRNAmiRNA,微型核糖核酸)是多種生理功能的重要調控因子,並已成為許多疾病治療的重要標靶[1]miRNA 本身並不會被轉譯成蛋白質,而是透過轉錄後基因調控(post-transcriptional gene regulation 的機制,其能夠與特定的 messenger RNAmRNA,信使 RNA)結合,抑制或調節mRNA 的轉譯而控制蛋白質的合成[1][2]。其中,miR-29 分子家族(包括 miR-29amiR-29b miR-29c)被發現與衰老過程有著密切相關。過去的研究發現此miRNA在正常衰老與早衰模型中的表達有上升的現象[3] [4],此外,miR-29 在多種生物過程中皆發揮調節的功用,涵蓋代謝(metabolism)、免疫反應(immunity)以及纖維化(fibrosis[4] [5] [6],這些生物過程與老化均有所關聯。儘管如此,單一 miRNA 是否能夠獨立驅動衰老仍是一項未解之謎。於此,本研究旨在探討 miR-29 在衰老過程中的具體功能,並透過實驗揭示其對衰老表型的影響。  

為了驗證 miR-29 在衰老過程中的表現變化,研究團隊分析 miR-29 在不同年齡恆河猴(Rhesus macaque)肝臟的表現量,觀察到 miR-29 水平會隨著年齡增加 (圖一A);在早衰小鼠模型中(LmnaG609G knock-in 小鼠,用於研究早年衰老症候群{Hutchinson-Gilford Progeria syndrome})也發現類似的現象,且以 miR-29b 最為顯著、並在各組織當中有高量的表現(圖一B)。為了瞭解 miR-29 以何種分子調控機制來驅動老化,研究團隊分析小鼠肝臟在正常與衰老過程中表達差異的基因,他們發現在老化過程中下調(downregulate)的基因富含 miR-29 目標基因,其中與細胞外基質相關基因最為顯著,更顯示出老化過程中基因表現的變化可能是 miR-29 水平升高所造成的結果(圖一C)。

圖一、miR-29 是衰老小鼠中基因表達變化的潛在驅動因子(A) miR-29a、miR-29b 和 miR-29 在恆河猴肝臟中隨著年齡變化的相關性分析。(B)針對 miR-29b-3p 的表現量分析,發現其在年老的組別中表現量顯著較高。(C) 左:火山圖 (Volcano plot)顯示在老年小鼠上調(紅色)和下調(藍色)的基因。中:在老年小鼠下調基因中,富集了由於 miR-29 家族所下調的基因。右:基因途徑富集(Gene Ontology)分析顯示出老年小鼠肝臟中顯著下調的基因路徑。 圖片來源:https://doi.org/10.1038/s42003-024-06735-z

研究團隊進一步利用調控 miR-29 的表現量來驗證其對衰老相關表型 (aging-related phenotypes)的影響。使用早衰小鼠模型(Zmpste24-/- 小鼠,另一常用於研究早年衰老症候群{Hutchinson-Gilford Progeria syndrome}的模式動物),發現降低 miR-29 的表現量可顯著延長其壽命(圖二A)。反之若在野生型小鼠中過量表達 miR-29,會誘發衰老相關表型並導致存活率下降(圖二B),其表型包括毛髮灰白、駝背、皮膚變薄及骨密度下降(osteoporosis)等(圖二C)。

圖二、miR-29對於衰老表型衰老相關表型(aging-related phenotypes)的影響 (A)在早衰小鼠模型中降低 miR-29 的表達能有效提升存活率。(B)在野生型小鼠中過量表達 miR-29 會導致小鼠存活率下降。(C)過量表達 miR-29 的小鼠在兩個月大時已呈現衰老的表型(左),除了有骨質密度降低的情形(中),透過測定 SA-β-gal 的表現量也顯示腎臟衰老的程度也顯示其已與年老的小鼠相當(右)。 圖片來源:https://doi.org/10.1038/s42003-024-06735-z

為了揭示 miR-29 如何驅動衰老,研究者進行了轉錄組分析(transcriptome analysis),比較年輕小鼠與過量表達 miR-29 小鼠的基因表達差異。結果顯示,過量表達 miR-29 的小鼠與老年小鼠在基因表達上有許多共同特徵,這些基因變化與衰老表徵密切相關(圖三)。例如,膠原蛋白合成(collagen synthesis)相關基因的表達減少,脂肪酸代謝(fatty acid metabolism)相關基因下調,而炎症(inflammation)相關基因則顯著上調。這些發現進一步證實 miR-29 在調控衰老相關基因表達中發揮著關鍵作用。

圖三、miR-29 驅動的與衰老相關的轉錄組變化 比較年輕小鼠與過量表達 miR-29 小鼠肝臟的基因表達差異(上排),以及過量表達 miR-29 的小鼠與老年小鼠在基因表達之共同特徵(下排)。 圖片來源:https://doi.org/10.1038/s42003-024-06735-z

總結而言,研究證實 miR-29 在衰老過程中扮演關鍵角色,不僅與衰老相關的基因表達變化密切相關,還能直接促進衰老進程並引發多種衰老表徵。這些發現揭示,選擇性抑制 miR-29 的表達可能成為未來抗衰老療法的重要方向。回顧 2024 年諾貝爾生理學或醫學獎對 microRNA 發現的肯定,這一領域不僅顛覆了我們對基因表達與調控的傳統認知,更為醫學帶來革命性變革。隨著 microRNA 研究的深入,未來有望開發更多基於 microRNA 的診斷與治療技術,為疾病治療提供新希望。

延伸閱讀:

  1.  【諾貝爾獎主題月】基因調控小幫手miRNA
  2. 微小 RNA,大大改變!2024 諾貝爾生醫獎揭示基因調控新篇章

Main Article: Swahari, V., Nakamura, A., Hollville, E., Hung, Y. H., Kanke, M., Kurtz, C. L., Caravia, X. M., Roiz-Valle, D., He, S., Krishnamurthy, J., Kapoor, S., Prasad, V., Flowers, C., Beck, M., Baran-Gale, J., Sharpless, N., López-Otín, C., Sethupathy, P., & Deshmukh, M. (2024). miR-29 is an important driver of ageing-related phenotypes. Communications biology, 7(1), 1055. https://doi.org/10.1038/s42003-024-06735-z

參考文獻:

  1.     Bartel D. P. (2018). Metazoan MicroRNAs. Cell, 173(1), 20–51. https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.03.006
  2.     Bartel D. P. (2009). MicroRNAs: target recognition and regulatory functions. Cell, 136(2), 215–233. https://doi.org/10.1016/j.cell.2009.01.002
  3.     Wissink, E. M., Smith, N. L., Spektor, R., Rudd, B. D., & Grimson, A. (2015). MicroRNAs and Their Targets Are Differentially Regulated in Adult and Neonatal Mouse CD8+ T Cells. Genetics, 201(3), 1017–1030. https://doi.org/10.1534/genetics.115.179176
  4.     Yee Mon, K. J., Zhu, H., Daly, C. W. P., Vu, L. T., Smith, N. L., Patel, R., Topham, D. J., Scheible, K., Jambo, K., Le, M. T. N., Rudd, B. D., & Grimson, A. (2021). MicroRNA-29 specifies age-related differences in the CD8+ T cell immune response. Cell reports, 37(6), 109969. https://doi.org/10.1016/j.celrep.2021.109969
  5.     Dalgaard, L. T., Sørensen, A. E., Hardikar, A. A., & Joglekar, M. V. (2022). The microRNA-29 family: role in metabolism and metabolic disease. American journal of physiology. Cell physiology, 323(2), C367–C377. https://doi.org/10.1152/ajpcell.00051.2022
  6.     an Rooij, E., Sutherland, L. B., Thatcher, J. E., DiMaio, J. M., Naseem, R. H., Marshall, W. S., Hill, J. A., & Olson, E. N. (2008). Dysregulation of microRNAs after myocardial infarction reveals a role of miR-29 in cardiac fibrosis. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 105(35), 13027–13032. https://doi.org/10.1073/pnas.0805038105

 

關鍵字:諾貝爾獎主題月、microRNAsagingfatty acid metabolismcollagen synthesisinflammation

撰文|陳祈瀅
審稿|葉國掄

About the author

陳 祈瀅

陳 祈瀅

一位藏著文科魂的理科女子,2021年國立陽明大學基因體科學研究所碩士畢業,2020年國立政治大學生物科技管理學程學生,目前就職於新加坡科技研究局(A*STAR)。主要研究領域為分子內分泌學和癌症生物學,對於內分泌代謝與神經系統的交互作用格外感興趣,也熱衷探討科技與人文的相關議題。
生命是一種長期持續累積的過程,科學亦然,期盼在知識的洪流當中能留下一絲足跡。

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