影像技術在生命科學研究裡扮演越來越重要的角色,加大了現今影像的資料量。生物影像因此逐漸需要依靠軟體的分析來更快速的得到客觀與更精準的資訊。
在這個工作坊中,你將學習如何使用 Python ,學習影像分析的基礎流程,以及如何思考影像分析問題,並認識現今常被使用的機器學習工具。這也是認識其他做生物影像人的好機會!
本次活動僅開放實體,不額外開放線上參與,報名人數上限為三十人(額滿為止),請有興趣的各位盡速報名,以免向隅。
報名表單:https://forms.gle/ugUuAb3epbyjiKgi7
📆 活動資訊:
時間:
2024/12/28(星期六) 09:10開始報到,09:30-15:30 Python初學者工作坊
2024/12/29(星期日) 08:40開始報到,09:00-18:00 生物影像分析工作坊
地點:國立陽明交通大學傳統醫學大樓甲棟101生科教室(台北市北投區立農街二段155號)
主辦單位:The Investigator Taiwan
協辦單位:國家科學及技術委員會補助生命科學研究推動中心
2024/12/28(星期六) 09:10開始報到,09:30-15:30 Python初學者工作坊
2024/12/29(星期日) 08:40開始報到,09:00-18:00 生物影像分析工作坊
地點:國立陽明交通大學傳統醫學大樓甲棟101生科教室(台北市北投區立農街二段155號)
主辦單位:The Investigator Taiwan
協辦單位:國家科學及技術委員會補助生命科學研究推動中心
🎤詳細議程
2024/12/28(星期六)
0910 開始報到
0930-1530 Python 初學者工作坊
2024/12/29(星期日)
0840 開始報到
0900-0930 Section 0:影像處理的專門用語
學習術語:什麼是bits/pixels/voxels/images?
0930-1200 Section 1:影像處理的基本流程
什麼是image thresholding/filtering/transforms?
Codelab#1:學習使用Python進行影像處理,將提供帶有註解的Jupyter筆記本。
1300-1530 Section 2:AI在影像處理的應用
演算法的基本介紹及正確的使用方式。
現有的軟體介紹-Cellpose 和ilastik以及如何選擇開源軟體。
Codelab#2:嘗試Cellpose和ilastik,並學習使用Python進行影像以及資料分析。
1600-1800 Section 3 影像處理的思考方式
Case study:小組討論影像處理方式。
其他資源介紹。
1800- 聚餐(自由參加)
講者:黃承宇
劍橋大學 神經科學博士候選人
在日本出生的台灣人,大學就讀物理系,主要研究課題為生物物理以及生物資料分析。目前在劍橋大學進行失憶症相關研究,同時每年在日本以及台灣教學影像分析方法。
💻報名方案和費用
- 報名方案一(一般身份)
- 12/28和12/29(共兩天): 報名費1000元,有出席退200元。
- 12/29 (僅第二天):報名費600,有出席退100元。
- 報名方案二(Investigator成員、陽明交通大學在學學生)
- 12/28和12/29(共兩天) :報名費800元,有出席退200元。
- 12/29(僅第二天) :報名費500元,有出席退100元。
- 報名方案三(陽明交通大學生科系暨基因體科學研究所在學學生:限前5位報名者免費)
- 12/28和12/29(共兩天) : 報名費800元,有出席退800元。
- 12/29 (僅第二天) :報名費500元,有出席退500元。
✍️ 報名請填寫表單:https://forms.gle/ugUuAb3epbyjiKgi7