發炎性腸道疾病（Inflammatory bowel disease, IBD）和腸道共生菌相變化有關。但 Virgin 教授的團隊發現，腸道內的病毒組（Virome）也在 IBD 中扮演重要角色。此研究成果刊載於 2015 年 1 月 22 日的 Cell。
對抗 IBD 的歷史相當長，十六世紀即有相關記載。目前全美約有一百三十萬患者。IBD是慢性且易復發的腸道發炎性疾病群，其詳細致病原因目前不明。可能是由遺傳、環境等因素，造成對腸道正常菌落異常的免疫反應。IBD 可分為兩種，克隆氏症（Crohn’s disease, CD）和潰瘍性結腸炎（Ulcerative colitis, UC）。過去最受到關注的就是腸內菌相和黏膜免疫反應。近來有不少研究顯示，病毒組與 IBD 的發生有關，而病毒組的主要組成 – 嗜菌體也會由掠食者-獵物的關係影響腸道細菌群落。
先前研究未詳細描述腸道的病毒組。華盛頓大學的團隊，藉由宏基因組測序（metagenomic sequencing）將 UC、CD 病患以及同一地區（或同一家庭）正常人的糞便樣本類病毒粒子（virus-like particle,VLP）之 DNA 進行比較，在排除生活環境的影響後，觀察嗜菌體、細菌和 IBD 的關係。他們採用了來自英國、美國芝加哥及洛杉磯三個世代進行研究，並以兩個生態指標: 豐富度（richness）和多樣性（diversity）來比較。研究團隊另外以 16s rRNA 定序以瞭解菌相改變的情形。考慮到多項因素（如健康狀態、性別、年紀等）對結果的影響，其他變項被加入多變量關聯的線型模型（Multivariate association with linear model）進行分析。
在 IBD 病患腸道中，病毒組具特有之變化。以豐富度而言，尾噬菌體目（Caudovirale）上升，微小嗜菌體科（Microviridae）則下降，且 CD 組和 UC 組所增加的尾噬菌體目病毒種類並不相同。可見不同的 IBD 疾病類別，其腸道的病毒組有特異性。一般認為腸道細菌和 IBD 密切相關，不過這次觀察到的病毒組變化，無法單由細菌群落多樣性、豐富度下降來解釋。
「這個發現只是冰山一角，」Virgin 教授受訪時指出，他們也發現了很多過去不知曉的病毒，病毒組和腸道健康的互動尚不明朗。作者推測，腸道內嗜菌體組成的改變，進而影響微生物相與消化系統，誘發 IBD。或許因為病人腸道內的病毒組影響了糞便的細菌組成，使糞便移植治療 IBD 未見顯著成效。過去人們普遍忽略了病毒組在腸道健康、代謝疾病中之作用，將來研究腸道微生物相，除了聚焦細菌，也應了解病毒組在其中扮演的角色。
圖說：腸道內病毒組在 IBD 中扮演重要角色。圖片來源：http://goo.gl/Hw2iSh
參考資料：
- Norman, J., Handley, S., Baldridge, M., Droit, L., Liu, C., Keller, B., … Virgin, H. (2015). Disease-Specific Alterations in the Enteric Virome in Inflammatory Bowel Disease. Cell, 160(3), 447-460. doi:10.1016/j.cell.2015.01.002
撰文 | 童柏雅
修訂 | 熊浩安
