新冠病毒 (SARS-CoV-2) 持續蔓延,各國已開始施打多種疫苗,但除了預防,治療藥物也必不可少。科學界持續關注小分子藥物此一常使用的治療手段,尤其是以老藥新用為概念出發去尋找藥物,因為已知小分子的安全性等各項特性都相對清楚,預期能縮短開發時間。中研院翁啟惠院士、洪上程特聘研究員、馬徹研究員及臺大藥學系梁碧惠副教授所領導的團隊,就透過一連串細胞感染試驗 (cell-based infection assay)、酵素實驗 (enzymatic assays)、分子模擬 (molecular modeling) 以及自行開發的黃金倉鼠 (golden hamster) 動物模式 (animal model) 嘗試在這方面的科學研究做出一些貢獻[1]。
該團隊一開始使用 Vero E6 [2]的細胞感染試驗篩選候選藥物。Vero E6 細胞是源自於非洲綠猴的上皮腎細胞,並高度表達新冠病毒感染所經的 ACE2 蛋白。由於 ACE2 蛋白也是 SARS 病毒主要的感染途徑,從 2003 年起已被廣泛使用迄今。在最近的新冠肺炎研究中,也被用於評估病毒的細胞病變作用 (cytopathogenic effect, CPE)[3][4]。
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藉由 Vero E6 細胞感染試驗,從 2855 種市場現有的藥物中,該團隊初步找出 15 種具有抵抗病毒功效的藥物 (圖一)主要可以分為六大類:蛋白酶抑制劑 (protease inhibitior)、鳥嘌呤類似物 (guanine analog)、奎寧類似物 (quinine analog)、病毒功能抑制劑(包含抑制病毒入侵細胞、進入細胞核或進行複製)、離子通道調節子 (ion channel modulator)、離子導體 (ionophore)。
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研究團隊為了解這 15 種藥物的主要作用機制,便測試其對兩種 SARS-CoV-2 複製、轉錄過程中蛋白酶 (protease, 見圖二)[5]:PL 蛋白酶 (papain-like protease) 與 3CL 蛋白酶 (3C-like protease),的抑制效果。結果顯示 nelfinavir mesylate (以下簡稱nelfinavir) 和 boceprevir 都會抑制 3CL 蛋白酶。然而這兩種藥物在細胞感染試驗與蛋白酶活性抑制實驗中表現相反:nelfinavir 在細胞感染試驗中有較好的抗病毒效力,但 boceprevir 對 3CL 蛋白酶的抑制力較佳,因此團隊進一步以分子嵌合 (molecular docking) 模擬分析兩者與 3CL 蛋白酶的交互作用(圖三),結果顯示確實有所不同:Nelfinavir 主要透過 SARS-CoV-2 3CL 蛋白酶的 Gly143、Glu166 及 Gln189 三個氨基酸殘基(amino acid residue)作用,而 boceprevir 則是透過His41、Gly143、His164 及 Glu166 這四個氨基酸殘基作用。
另一方面,該團隊也測試了 190 種中草藥,發現以下幾種中草藥家族的水相萃取物 (aqueous extracts):
- Mentheae (Mentha haplocalyx(薄荷))
- Asteraceae (Taraxacum mongolicum、Tussilago farfara、Chrysanthemum morifolium)
- Theaceae (Camellia sinensis)
- Lamiaceae (Perilla frutescens(紫蘇)、Prunella vulgaris、Ocimum basilicum、Salvia hispanica、Nepeta tenuifolia、Salvia rosmarinus)
- Fabaceae (Arachis hypogaea、Spatholobus suberectus)及Sapindaceae (Dimocarpus longan、 Litchi chinensis)
經由16到960倍不等的稀釋,能夠降低新冠病毒的細胞病變作用(圖四)。更驚人的是,該團隊先前從靈芝 (Ganoderma lucidum, Reishi) 分離出的一系列含有L-岩藻醣 (L-fucose) 的多醣 (polysaccharides) 化合物中[6],RF3 (Reishi L-fucose–containing polysaccharides fraction 3) 經過 1280 倍的稀釋仍能具有抗病毒的效用,且不具有任何細胞毒性(圖四)。
經過綜合考量,團隊將4種市面上的藥物 (mefloquine、nelfinavir、salinomycin及thioguanine) 和3種中草藥 (RF3、紫蘇及薄荷) 的萃取物,進一步在自行開發的黃金倉鼠(golden Syrian hamsters,即卡通哈姆太郎的原型) 動物模式 (animal model) 中做藥物效果的試驗 (圖五)。發現除了 salinomycin 外,這些測試的藥物和萃取物都沒有急性毒性 (actue toxicity) (圖五B),而在降低毒附載 (viral load) 表現方面,mefloquine 及薄荷萃取物在感染 SARS-CoV-2 的倉鼠身上具有最顯著的效果,而 Nelfinavir、RF3 和紫蘇萃取物次之(圖五A)。因而研究團隊總結出,市面上現有的 mefloquine、nelfinavir 及從靈芝分離出的 RF3、紫蘇和薄荷的水相萃取物是具有潛力被開發成治療 SARS-CoV-2 的藥物。然而需要注意的是,倉鼠動物模和人體畢竟還是不完全相同,抗 SARS-CoV-2 藥物的開發,還有一段路要走。
參考文獻:
[1] Jan, Jia-Tsrong, et al. “Identification of existing pharmaceuticals and herbal medicines as inhibitors of SARS-CoV-2 infection.” Proceedings of the National Academy of Sciences 118.5 (2021).
[2] Wu, Chung-Yi, et al. “Small molecules targeting severe acute respiratory syndrome human coronavirus.” Proceedings of the National Academy of Sciences 101.27 (2004): 10012-10017.
[3] Hoffmann, Markus, et al. “SARS-CoV-2 cell entry depends on ACE2 and TMPRSS2 and is blocked by a clinically proven protease inhibitor.” Cell 181.2 (2020): 271-280.
[4] Matsuyama, Shutoku, et al. “Enhanced isolation of SARS-CoV-2 by TMPRSS2-expressing cells.” Proceedings of the National Academy of Sciences 117.13 (2020): 7001-7003.
[5] Cannalire, Rolando, et al. “Targeting SARS-CoV-2 Proteases and Polymerase for COVID-19 Treatment: State of the Art and Future Opportunities.” Journal of medicinal chemistry (2020).
[6] Liao, Shih-Fen, et al. “Immunization of fucose-containing polysaccharides from Reishi mushroom induces antibodies to tumor-associated Globo H-series epitopes.” Proceedings of the National Academy of Sciences 110.34 (2013): 13809-13814.
關鍵字:老藥新用、動物模式、藥物開發
撰文|蕭毅
審稿|黃云宣
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