藥物是疾病治療的主力之一，然而，新藥開發曠日費時、失敗率高，如何精準找出最有潛力的化合物，以提高後續臨床試驗成功機率並降低開發成本、加速開發，一直是研究的一大重點。隨著研究方法的創新，已有不同的方法...
分類 -計算生物學
2021 年 10 月回顧：小分子藥物主題月
分子建模之應用：開發第三代 NSAID 藥物
過去，從尋找生物標的到新藥開發至少需要耗費十年以上的時間，但如今有了計算化學的加入，透過電腦模擬輔助藥物開發已成功協助許多藥物的上市。在這篇研究中，巴西馬卡帕公立大學（Federal...
電腦輔助藥物設計打破缺藥僵局：以熱帶血吸蟲病為例
傳統藥物開發多半是如大海撈針，從茫茫化合物海中逐一試驗以找出適合的潛力藥物，高通量（high...
七月主題：生物與奈米材料交界的十字路口
奈米科技在近十年有長足的進展，例如大家最常聯想到的半導體科技。日新月異的半導體科技得以將半導體元件縮小在更小的表面積上，使得手機也能擁有電腦的運算能力。在生醫研究領域上，奈米材料也有許多意想不到的應...
利用計算科學開發 DNA 嵌合抗癌藥物的潛能
抗癌藥物已成為化療、切除等傳統療法以外的新興利器，其一大宗即是DNA嵌合（intercalation）藥物，透過小分子藥物與DNA的嵌合，抑制癌細胞後續 DNA 及RNA...
Foldit：蛋白質折疊領域的 Ender’s Game
隨著技術的進展與突破，科學家從研究中能獲取越來越大量的資料，但未必有足夠的資源和時間去分析這些資料，此時群眾外包（crowdsourcing）和分散式運算突破了此一瓶頸：將需要大量計算的資料分割成小...
系統性尋找具有抗癌潛能的非癌症用藥 – PRISM方法
老藥新用的成功常是偶然，Broad Institute 為首的研究團隊開發出系統性的測試平台，將不同癌細胞株以特定 DNA 片段編碼並投以多種現有老藥，進一步運算分析細胞株中各基因 mRNA...
電腦選的啦 ! 利用模擬篩選新冠狀病毒潛在治療藥物
根據約翰霍普金斯大學 (Johns Hopkins University) 統計，截至台灣時間 5 月 31 日止，全球新型冠狀肺炎確診病例已突破 600 萬例，造成 36 萬 8604...
DeepSynergy：以類神經網路預測抗癌藥物組合的新可能
傳統製藥方法以生物製造和化學合成為主，必須測試數種化合物、經過人體試驗，才可能開發出新藥；縱使如此，在投入大量時間和資源下，能成功開發出新藥的可能性依舊很低。隨著生物技術的發展，科學家也得以使用高速...
利用藥物構效關係（SAR & SKAR）策略打擊阿茲海默症
阿茲海默症（Alzheimer’s disease，AD）是蛋白質錯誤摺疊所導致的疾病之一，而澱粉樣蛋白-β（Amyloid-β，Aβ）在腦內的堆積被認為是造成阿茲海默症的初期關鍵...