過去,從尋找生物標的到新藥開發至少需要耗費十年以上的時間,但如今有了計算化學的加入,透過電腦模擬輔助藥物開發已成功協助許多藥物的上市。在這篇研究中,巴西馬卡帕公立大學(Federal...
分類 -生物資訊學
電腦輔助藥物設計打破缺藥僵局:以熱帶血吸蟲病為例
傳統藥物開發多半是如大海撈針,從茫茫化合物海中逐一試驗以找出適合的潛力藥物,高通量(high...
神經細胞與有機半導體的結合–精巧的仿化學突觸裝置
類神經網路(Artificial Neural Network)推進了許多領域的進展,他讓電腦可以識別圖片中的物體、擊敗職業圍棋棋士、更準確的翻譯。類神經網路也被應用在建立腦機介面(Brain...
#NEWS AlphaFold 與 RoseTTAFold:蛋白質結構預測誰更勝一籌?
蛋白質結構預測一直是科學家矢志解決的一大難題,國際間更有 CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure...
七月主題:生物與奈米材料交界的十字路口
奈米科技在近十年有長足的進展,例如大家最常聯想到的半導體科技。日新月異的半導體科技得以將半導體元件縮小在更小的表面積上,使得手機也能擁有電腦的運算能力。在生醫研究領域上,奈米材料也有許多意想不到的應...
分子模擬篩選出有望抑制 SARS-CoV-2 病毒複製的海洋天然物
造成全球大流行的 SARS-CoV-2 屬於冠狀病毒科的單股 RNA 病毒,其藉由棘蛋白(spike protein)進入宿主細胞後,會由轉譯開啟病毒的複製週期,首先基因組轉譯出兩條多聚蛋白,接著...
以蛋白質體學分析新冠肺炎患者的多重器官損傷
新型冠狀病毒引發的COVID-19疫情仍肆虐著全球,除了眾所期盼的疫苗研發,對於感染患者的治療亦是科學家關注的焦點。中國的研究團隊收集了因COVID-19病逝的患者檢體,以蛋白質體學分析SARS...
利用計算科學開發 DNA 嵌合抗癌藥物的潛能
抗癌藥物已成為化療、切除等傳統療法以外的新興利器,其一大宗即是DNA嵌合(intercalation)藥物,透過小分子藥物與DNA的嵌合,抑制癌細胞後續 DNA 及RNA...
Foldit:蛋白質折疊領域的 Ender’s Game
隨著技術的進展與突破,科學家從研究中能獲取越來越大量的資料,但未必有足夠的資源和時間去分析這些資料,此時群眾外包(crowdsourcing)和分散式運算突破了此一瓶頸:將需要大量計算的資料分割成小...
系統性尋找具有抗癌潛能的非癌症用藥 – PRISM方法
老藥新用的成功常是偶然,Broad Institute 為首的研究團隊開發出系統性的測試平台,將不同癌細胞株以特定 DNA 片段編碼並投以多種現有老藥,進一步運算分析細胞株中各基因 mRNA...
利用人工智慧篩選抗生素對抗超級細菌
抗生素自發明以來,拯救了無數人的性命。自最初從黴菌中提煉的青黴素,現在已經有許多不同的抗生素,藉由不同的機制來抑制細菌的生長。然而,隨著抗生素使用的普及與濫用,細菌得以逐漸演化而獲得抗藥性。能抵抗大...